cbaf

DOI:10.18129 / B9.bioc.cbaf

自动化功能比较各种使数据从cbioportal.org

Bioconductor版本:版本(3.16)

这个包包含函数,使分析和比较数据跨各种肿瘤/癌症使子组。到目前为止,它是与RNA-seq兼容,microRNA-seq,微阵列和甲基化数据集存储在cbioportal.org。

作者:阿曼Shahrisa (aut、cre cph], Maryam塔玛色比Birgani (aut)

维护人员:阿曼Shahrisa < Shahrisa。阿曼在hotmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cbaf”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cbaf”)

HTML	R脚本	cbaf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AssayDomain,BiomedicalInformatics,ComparativeGenomics,DNAMethylation,表观遗传学,GeneExpression,遗传学,微阵列,ResearchField,软件,转录,转录组
版本	1.20.1
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1)
进口	BiocFileCache,RColorBrewer,cBioPortalData,genefilter,gplots,统计grDevices跑龙套,openxlsx
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cbaf_1.20.1.tar.gz
Windows二进制	cbaf_1.20.1.zip
macOS二进制(x86_64)	cbaf_1.20.1.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cbaf
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cbaf
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/cbaf/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cbaf/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.16源码包	源存档