Bnem
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doi：10.18129/b9.bioc.bnem
这是发展Bnem的版本；对于稳定版本，请参阅Bnem。
从扰动实验的间接测量中训练逻辑模型
生物导体版本：开发（3.16）
BNEM结合了嵌套效应模型（软件包MNEM）间接测量的使用与Cellnoptr的布尔网络的使用。分析了细胞中信号传导淋巴结的扰动实验，以实现其对全局基因表达谱的影响。这些概况为网络中下游节点的布尔调节提供了证据，例如，两个父母是独立地（OR-GATE）还是联合（和栅极）激活孩子。
作者：Martin Pirkl [AUT，CRE]
维护者：Martin Pirkl
引用（从r内，输入引用（“ Bnem”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ bnem”）的用法
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Bnem”）
| html | R脚本 | bnem.html |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 基因表达，，，，结肠管制，，，，网络，，，，网络引导，，，，途径，，，，预处理，，，，软件，，，，系统生物学 |
| 版本 | 1.5.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.13（R-4.1）（1。5年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | R（> = 4.1） |
| 进口 | Cellnoptr，，，，矩阵，，，，降雪，，，，rgraphviz，，，，簇，，，，Flexclust，统计rcolorbrewer，，，，Epinem，，，，mnem，，，，生物酶，方法，utils，图形，图形，，，，副词，，，，Binom，，，，林玛，，，，SVA，，，，VSN，，，，rmarkDown |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，生物基因 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/martinfxp/bnem/ |
| BugReports | https://github.com/martinfxp/bnem/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | bnem_1.5.0.tar.gz |
| Windows二进制 | bnem_1.5.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | BNEM_1.5.0.TGZ |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bnem |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/bnem |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bnem/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
