BNBC

doi:10.18129/b9.bioc.bnbc

这是发展BNBC的版本;对于稳定版本,请参阅BNBC

频带归一化和批处理HI-C数据

生物导体版本:开发(3.16)

从重复的工具将(几个)HI-C数据归一化。

作者:Kipper Fletez-Brant [CRE,AUT],Kasper Daniel Hansen [aut]

维护者:gmail.com上的Kipper Fletez-Brant

引用(从r内,输入引用(“ BNBC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ bnbc”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ BNBC”)

html R脚本 BNBC用户指南
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 ,,,,正常化,,,,预处理,,,,软件
版本 1.19.0
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.5.0),方法,生物基因,,,,总结性特征,,,,基因组机
进口 RCPP(> = 0.12.12),iranges,,,,RHDF5,,,,Data.Table,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS,,,,矩阵,,,,预处理,,,,SVA, 平行,ebimage,UTILS
链接 RCPP
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,运行
系统要求
增强
URL https://github.com/hansenlab/bnbc
BugReports https://github.com/hansenlab/bnbc/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 BNBC_1.19.0.tar.gz
Windows二进制 BNBC_1.19.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) BNBC_1.19.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bnbc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/bnbc
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/bnbc/
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