这是发展BNBC的版本;对于稳定版本,请参阅BNBC。
生物导体版本:开发(3.16)
从重复的工具将(几个)HI-C数据归一化。
作者:Kipper Fletez-Brant [CRE,AUT],Kasper Daniel Hansen [aut]
维护者:gmail.com上的Kipper Fletez-Brant
引用(从r内,输入引用(“ BNBC”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ bnbc”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ BNBC”)
html | R脚本 | BNBC用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 嗝,,,,正常化,,,,预处理,,,,软件 |
版本 | 1.19.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.6(R-3.4)(5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.5.0),方法,生物基因,,,,总结性特征,,,,基因组机 |
进口 | RCPP(> = 0.12.12),iranges,,,,RHDF5,,,,Data.Table,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS,,,,矩阵,,,,预处理,,,,SVA, 平行,ebimage,UTILS |
链接 | RCPP |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,运行 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/hansenlab/bnbc |
BugReports | https://github.com/hansenlab/bnbc/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | BNBC_1.19.0.tar.gz |
Windows二进制 | BNBC_1.19.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | BNBC_1.19.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bnbc |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/bnbc |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bnbc/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |