transcriptogramer

DOI:10.18129 / B9.bioc.transcriptogramer

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅transcriptogramer。

基于transcriptograms转录分析

Bioconductor版本:3.16

基于transcriptograms转录分析R包,一个项目表达式值的方法来分析转录组一组有序蛋白质,安排这样的概率基因产物参与相同的代谢途径指数随距离的增加而减小两个蛋白质之间的排序。Transcriptograms,因此,全基因组基因表达谱,为细胞代谢提供一个全局视图,同时表明基因集的表达式是改变。

作者:迭戈莫莱斯(aut (cre),罗德里戈Dalmolin (aut)

维修工:极其迭戈< vinx在ufrn.edu.br >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“transcriptogramer”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML	R脚本	transcriptogramer用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,ImmunoOncology,微阵列,网络,RNASeq,软件,SystemsBiology,转录,可视化
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 3.4),方法
进口	biomaRt、数据。表、doSNOW foreach ggplot2,图形,grDevices, igraph,limma平行,进步,红色的、雪、统计、tidyr,topGO
链接
建议	BiocStyle,rmarkdown knitr RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements	Java运行时环境(> = 6)
增强了
URL	https://github.com/arthurvinx/transcriptogramer
BugReports	https://github.com/arthurvinx/transcriptogramer/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	transcriptogramer_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	transcriptogramer_1.20.0.zip
macOS二进制(x86_64)	transcriptogramer_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64)	transcriptogramer_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transcriptogramer
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ transcriptogramer
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/transcriptogramer/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/transcriptogramer/
包下载报告	下载数据