这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅pRoloc。
Bioconductor版本:3.16
pRoloc包实现了机器学习和可视化方法的分析和interogation quantitiative质谱数据可靠推断蛋白质亚细胞定位。
作者:Laurent与奥利弗和m . Breckels骗子和丽莎来自托马斯汉堡和塞缪尔Wieczorek
维修工:Laurent与<劳伦。与在uclouvain.be >
从内部引用(R,回车引用(“pRoloc”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“pRoloc”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“pRoloc”)
HTML | R脚本 | 空间蛋白质组学的迁移学习算法 |
HTML | R脚本 | 注释空间蛋白质组学数据 |
HTML | R脚本 | 贝叶斯空间与pRoloc蛋白质组学 |
HTML | R脚本 | 机器学习技术在pRoloc可用 |
HTML | R脚本 | 使用pRoloc空间蛋白质组学数据分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
视频 | pRoloc, pRolocdata pRolocGUI |
biocViews | 分类,聚类,ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,质量控制,软件 |
版本 | 1.38.2 |
Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(10年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 3.5),MSnbase(> = 1.19.20),MLInterfaces(> = 1.67.10)、方法Rcpp (> = 0.10.3),BiocParallel |
进口 | stats4,Biobasemclust(> = 4.3),插入符号,e1071,抽样,类,kernlab,晶格,nnet, randomForest,代理,模糊神经网络,hexbin,BiocGenerics、统计、dendextend RColorBrewer尺度,质量,knitr, mvtnorm, LaplacesDemon, coda, mixtools, gtools, plyr, ggplot2,biomaRt跑龙套,grDevices图形 |
链接 | Rcpp, RcppArmadillo |
建议 | testthat rmarkdown,pRolocdata(> = 1.9.4)roxygen2、xtable rgl,BiocStyle(> = 2.5.19),hpar(> = 1.15.3)、dplyr akima,字段,素食,GO.db,AnnotationDbinipals Rtsne(> = 0.13),重塑,魔法 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/lgatto/pRoloc |
BugReports | https://github.com/lgatto/pRoloc/issues |
取决于我 | bandle,pRolocGUI |
进口我 | |
建议我 | MSnbase,pRolocdata,RforProteomics |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | pRoloc_1.38.2.tar.gz |
Windows二进制 | pRoloc_1.38.2.zip |
macOS二进制(x86_64) | pRoloc_1.38.2.tgz |
macOS二进制(arm64) | pRoloc_1.38.2.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pRoloc |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pRoloc |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/pRoloc/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/pRoloc/ |
包下载报告 | 下载数据 |