这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅杂环胺。
Bioconductor版本:3.16
这个包为用户提供查询人类细胞的能力阿特拉斯单细胞实验数据的数据存储库。“项目()”,“文件()”,“样品()”和“包()”功能在每个索引检索摘要信息;相应的‘* _details()可用于个人的每个索引条目。基于文件的资源可以下载使用“files_download ()”。先进的使用方案允许用户通过大型结果集页面,并灵活查询链表的链表的结构代表查询响应。
作者:玛雅麦克丹尼尔(aut),马丁·摩根(aut (cre)
维修工:马丁·摩根<马丁。摩根在roswellpark.org >
从内部引用(R,回车引用(hca)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(hca)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (hca)
HTML | R脚本 | 访问人类细胞图谱数据 |
HTML | R脚本 | 与人类细胞图谱表现 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | SingleCell,软件 |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.13 (r - 4.1)(2年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 4.1) |
进口 | httr、jsonlite dplyr,宠物猫、tidyr readr,BiocFileCache、工具、跑龙套、消化,闪亮,miniUI, DT |
链接 | |
建议 | LoomExperiment,SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,S4Vectors、方法、testthat (> = 3.0.0), knitr, rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | hca_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | hca_1.6.0.zip(64位) |
macOS二进制(x86_64) | hca_1.6.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | hca_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hca |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ hca |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/hca/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/hca/ |
包下载报告 | 下载数据 |