groHMM

DOI:10.18129 / B9.bioc.groHMM

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅groHMM

GRO-seq分析管道

Bioconductor版本:3.16

管道GRO-seq数据的分析。

作者:查尔斯·g·丹科米崔,安德烈•马丁斯w·李·克劳斯

维护人员:郁金香Nandu <郁金香。nandu utsouthwestern.edu >, w·李·克劳斯< lee.kraus utsouthwestern.edu >

从内部引用(R,回车引用(“groHMM”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“groHMM”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“groHMM”)

PDF R脚本 groHMM教程
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 测序,软件
版本 1.32.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(8.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R(> = 3.0.2),质量,平行,S4Vectors(> = 0.17.25),IRanges(> = 2.13.12),GenomeInfoDb,GenomicRanges(> = 1.31.8),GenomicAlignments(> = 1.15.6),rtracklayer(> = 1.39.7)
进口
链接
建议 BiocStyle,GenomicFeatures,刨边机,org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/Kraus-Lab/groHMM
BugReports https://github.com/Kraus-Lab/groHMM/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 groHMM_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 groHMM_1.32.0.zip
macOS二进制(x86_64) groHMM_1.32.0.tgz
macOS二进制(arm64) groHMM_1.32.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/groHMM
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ groHMM
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/groHMM/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/groHMM/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网