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groHMM
DOI:10.18129 / B9.bioc.groHMM
这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅groHMM。
GRO-seq分析管道
Bioconductor版本:3.16
管道GRO-seq数据的分析。
作者:查尔斯·g·丹科米崔,安德烈•马丁斯w·李·克劳斯
维护人员:郁金香Nandu <郁金香。nandu utsouthwestern.edu >, w·李·克劳斯< lee.kraus utsouthwestern.edu >
从内部引用(R,回车引用(“groHMM”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“groHMM”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“groHMM”)
| R脚本 | groHMM教程 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 测序,软件 |
| 版本 | 1.32.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(8.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R(> = 3.0.2),质量,平行,S4Vectors(> = 0.17.25),IRanges(> = 2.13.12),GenomeInfoDb,GenomicRanges(> = 1.31.8),GenomicAlignments(> = 1.15.6),rtracklayer(> = 1.39.7) |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,GenomicFeatures,刨边机,org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/Kraus-Lab/groHMM |
| BugReports | https://github.com/Kraus-Lab/groHMM/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | groHMM_1.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | groHMM_1.32.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | groHMM_1.32.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | groHMM_1.32.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/groHMM |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ groHMM |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/groHMM/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/groHMM/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
