fCCAC

DOI:10.18129 / B9.bioc.fCCAC

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅fCCAC。

功能的典型相关分析来评估核酸测序数据集之间的协方差

Bioconductor版本:3.16

计算评价可变性在DNA或RNA基因组测序数据集是一个至关重要的一步,因为它允许评估的再现性复制,并比较不同的数据集来识别潜在的相关性。fCCAC应用功能的典型相关分析允许评估:(i)生物或技术复制的再现性,分析他们在高阶协方差共享组件;(2)不同数据集之间的关系。fCCAC代表着一种更为复杂的方法,补充了皮尔森相关基因的报道。

作者:佩德罗情歌(aut (cre)

维护人员:佩德罗情歌< pmadrigal在ebi.ac.uk >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“fCCAC”)

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细节

biocViews	ATACSeq,ChIPSeq,报道,表观遗传学,FunctionalGenomics,MNaseSeq,RNASeq,测序,软件,转录
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.2.0),S4Vectors,IRanges,GenomicRanges、网格
进口	美国食品及药物管理局、RColorBrewergenomationggplot2,ComplexHeatmap,统计grDevices跑龙套
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,BiocStyle、knitr rmarkdown
SystemRequirements
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包档案

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源包	fCCAC_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	fCCAC_1.24.0.zip
macOS二进制(x86_64)	fCCAC_1.24.0.tgz
macOS二进制(arm64)	fCCAC_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fCCAC
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ fCCAC
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/fCCAC/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/fCCAC/
包下载报告	下载数据