doppelgangR

DOI:10.18129 / B9.bioc.doppelgangR

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅doppelgangR。

识别可能重复样本基因或元数据

Bioconductor版本:3.16

主要功能是doppelgangR(),它需要作为最小输入ExpressionSet对象的列表,列表和搜索所有对复制样品。搜索是基于基因组数据(exprs (eset)),表现型/临床数据(pData (eset)),和“吸烟枪”——据说pData中发现的惟一标识符(eset)。

作者:利沃尔德伦(aut (cre),马库斯拒绝前进(aut,施莱),马塞尔•拉莫斯(施)

维护人员:利未Waldron < lwaldron。研究在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“doppelgangR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“doppelgangR”)

HTML	R脚本	doppelgangR装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,ImmunoOncology,微阵列,质量控制,RNASeq,软件
版本	1.26.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(7年)
许可证	GPL (> = 2.0)
取决于	R (> = 3.5.0),Biobase,BiocParallel
进口	股东价值分析,嫁祸于,mnormt消化方法、grDevices图形,统计数据,SummarizedExperiment,跑龙套
链接
建议	BiocStyleknitr rmarkdown,curatedOvarianData,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lwaldron/doppelgangR
BugReports	https://github.com/lwaldron/doppelgangR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	doppelgangR_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	doppelgangR_1.26.0.zip
macOS二进制(x86_64)	doppelgangR_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64)	doppelgangR_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/doppelgangR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ doppelgangR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/doppelgangR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/doppelgangR/
包下载报告	下载数据