高山
DOI:10.18129 / B9.bioc.alpine
这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅高山。
高山
Bioconductor版本:3.16
片段序列偏差建模和修正RNA-seq转录丰度估计。
作者:迈克尔·爱,拉斐尔•伊
维修工:迈克尔爱< michaelisaiahlove gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“高山”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“高山”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“高山”)
| HTML | R脚本 | 高山 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | AlternativeSplicing,BatchEffect,报道,DifferentialSplicing,GeneExpression,归一化,质量控制,RNASeq,测序,软件,转录,可视化 |
| 版本 | 1.24.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.5.0) |
| 进口 | Biostrings,IRanges,GenomicRanges,GenomicAlignments,Rsamtools,SummarizedExperiment,GenomicFeaturesspeedglm样条函数,图,RBGLstringr、统计方法、图形GenomeInfoDb,S4Vectors |
| 链接 | |
| 建议 | knitr testthat,减价,alpineData,rtracklayer,ensembldb,BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38,RColorBrewer |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | alpine_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | alpine_1.24.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | alpine_1.24.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | alpine_1.24.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alpine |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/高山 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/alpine/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/alpine/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
