TrajectoryUtils

DOI:10.18129 / B9.bioc.TrajectoryUtils

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TrajectoryUtils。

单细胞轨迹分析工具

Bioconductor版本:3.16

实现底层工具为单细胞轨迹分析,主要用于内部重用高级包。包括一个函数创建一个集群级别最小生成树和数据结构来保存拟时间推理结果。

作者:亚伦Lun (aut (cre),凯利街(aut)

维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TrajectoryUtils”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“TrajectoryUtils”)

HTML	R脚本	轨迹公用事业
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneExpression,SingleCell,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	SingleCellExperiment
进口	方法、统计数据矩阵,igraph,S4Vectors,SummarizedExperiment
链接
建议	BiocNeighbors,DelayedArray,DelayedMatrixStats,BiocParalleltestthat knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/TrajectoryUtils
BugReports	https://github.com/LTLA/TrajectoryUtils/issues
取决于我	弹弓,TSCAN
进口我	调味品,singleCellTK,tradeSeq
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	TrajectoryUtils_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	TrajectoryUtils_1.6.0.zip
macOS二进制(x86_64)	TrajectoryUtils_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64)	TrajectoryUtils_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TrajectoryUtils
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TrajectoryUtils
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/TrajectoryUtils/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TrajectoryUtils/
包下载报告	下载数据