Statial

DOI:10.18129 / B9.bioc.Statial

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Statial。

一个包来确定细胞状态的变化相对于空间关联

Bioconductor版本:3.16

Statial是一套识别功能的细胞状态的变化。Statial提供可靠的量化提供的功能的细胞类型本地化不变的组织结构的改变。此外Statial揭示标记表达的变化与不同程度的本地化。这些特性可用于探讨不同细胞类型的结构和功能可能改变代理他们包围。

作者:Farhan Ameen (aut (cre),微酸的Iyengar (aut) Shila Ghazanfar (aut),埃利斯帕特里克(aut)

维护人员:Farhan Ameen < fame2827在uni.sydney.edu.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Statial”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“Statial”)

HTML	R脚本	介绍Statial
PDF		参考手册

细节

biocViews	SingleCell,软件,空间
版本	1.0.1
Bioconductor自	BioC 3.16 (r - 4.2)(< 6个月)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.1.0)
进口	BiocParallel,spatstat。几何学、concaveman tidyverse,数据。表,spatstat。探索,dplyr tidyr,SingleCellExperiment宠物猫,stringr tidyselect ggplot2,方法,统计数据
链接
建议	BiocStyle、knitr testthat (> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Statial_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	Statial_1.0.1.zip
macOS二进制(x86_64)	Statial_1.0.1.tgz
macOS二进制(arm64)	Statial_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Statial
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Statial
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Statial/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Statial/
包下载报告	下载数据