这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SpatialFeatureExperiment。
Bioconductor版本:3.16
一个新的S4类将简单的特性与R包科幻将地理空间数据分析方法基于矢量数据空间转录组。还实现了空间社区管理图形和几何操作。这个行囊,构建在SpatialExperiment SingleCellExperiment,因此这些仍然可以使用父类的方法。
作者:λ摩西(aut (cre)黑色,Lior Pachter (aut)
维护人员:摩西λ< dlu2 caltech.edu >
从内部引用(R,回车引用(“SpatialFeatureExperiment”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SpatialFeatureExperiment”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SpatialFeatureExperiment”)
HTML | R脚本 | 介绍SpatialFeatureExperiment类 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataRepresentation,软件,空间,转录组 |
版本 | 1.0.3 |
Bioconductor自 | BioC 3.16 (r - 4.2)(< 6个月) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 4.2.0) |
进口 | BiocGenerics,BiocParallel、方法、rjsonS4Vectors科幻小说,SingleCellExperiment,SpatialExperiment7)spdep (> = 1.1,SummarizedExperiment统计,跑龙套 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,DropletUtilsknitr,矩阵,rmarkdown,SFEDatatestthat (> = 3.0.0) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/pachterlab/SpatialFeatureExperiment |
BugReports | https://github.com/pachterlab/SpatialFeatureExperiment/issues |
取决于我 | |
进口我 | “航行者”号 |
建议我 | SFEData |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | SpatialFeatureExperiment_1.0.3.tar.gz |
Windows二进制 | SpatialFeatureExperiment_1.0.3.zip |
macOS二进制(x86_64) | SpatialFeatureExperiment_1.0.3.tgz |
macOS二进制(arm64) | SpatialFeatureExperiment_1.0.3.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SpatialFeatureExperiment |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SpatialFeatureExperiment |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SpatialFeatureExperiment/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SpatialFeatureExperiment/ |
包下载报告 | 下载数据 |