SpatialFeatureExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.SpatialFeatureExperiment

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SpatialFeatureExperiment

整合SpatialExperiment科幻小说简单的特性

Bioconductor版本:3.16

一个新的S4类将简单的特性与R包科幻将地理空间数据分析方法基于矢量数据空间转录组。还实现了空间社区管理图形和几何操作。这个行囊,构建在SpatialExperiment SingleCellExperiment,因此这些仍然可以使用父类的方法。

作者:λ摩西(aut (cre)黑色,Lior Pachter (aut)

维护人员:摩西λ< dlu2 caltech.edu >

从内部引用(R,回车引用(“SpatialFeatureExperiment”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SpatialFeatureExperiment”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SpatialFeatureExperiment”)

HTML R脚本 介绍SpatialFeatureExperiment类
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentation,软件,空间,转录组
版本 1.0.3
Bioconductor自 BioC 3.16 (r - 4.2)(< 6个月)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 4.2.0)
进口 BiocGenerics,BiocParallel、方法、rjsonS4Vectors科幻小说,SingleCellExperiment,SpatialExperiment7)spdep (> = 1.1,SummarizedExperiment统计,跑龙套
链接
建议 BiocStyle,DropletUtilsknitr,矩阵,rmarkdown,SFEDatatestthat (> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/pachterlab/SpatialFeatureExperiment
BugReports https://github.com/pachterlab/SpatialFeatureExperiment/issues
取决于我
进口我 “航行者”号
建议我 SFEData
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 SpatialFeatureExperiment_1.0.3.tar.gz
Windows二进制 SpatialFeatureExperiment_1.0.3.zip
macOS二进制(x86_64) SpatialFeatureExperiment_1.0.3.tgz
macOS二进制(arm64) SpatialFeatureExperiment_1.0.3.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SpatialFeatureExperiment
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SpatialFeatureExperiment
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SpatialFeatureExperiment/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SpatialFeatureExperiment/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网