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SingleCellSignalR
DOI:10.18129 / B9.bioc.SingleCellSignalR
这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SingleCellSignalR。
细胞信号使用单细胞RNAseq数据分析
Bioconductor版本:3.16
允许单个细胞RNA seq数据分析,聚类,创建内部网络和推断信息交互。
作者:西蒙Cabello-Aguilar (aut),雅克Colinge (cre, aut)
维护人员:雅克Colinge <雅克。colinge在inserm.fr >
从内部引用(R,回车引用(“SingleCellSignalR”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SingleCellSignalR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SingleCellSignalR”)
| HTML | R脚本 | my-vignette |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 分类,聚类,网络,RNASeq,SingleCell,软件 |
| 版本 | 1.10.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.11 (r - 4.0)(3年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 4.0) |
| 进口 | BiocManager circlize,limma,gplots igraph grDevices,刨边机,SIMLR、数据。表、pheatmap统计,Rtsne、图形stringr, foreach,乘,食物,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr, rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | tidySingleCellExperiment |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SingleCellSignalR_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SingleCellSignalR_1.10.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | SingleCellSignalR_1.10.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | SingleCellSignalR_1.10.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SingleCellSignalR |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SingleCellSignalR |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SingleCellSignalR/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SingleCellSignalR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
