RgnTX

DOI:10.18129 / B9.bioc.RgnTX

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RgnTX。

Colocalization转录组分析元素的存在异构体异构性和歧义

Bioconductor版本:3.16

RgnTX允许转录组注释的集成模型复杂的可变剪接模式。它支持转录组元素的测试没有明确同种型协会,这通常是真正的场景由于技术的局限性。它涉及的函数做permutaion测试评估特征和转录组区域之间的联系。

作者:王曰(aut (cre),贾庆林孟(aut)

维护人员:王曰<曰。在student.xjtlu.edu.cn wang19 >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RgnTX”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RgnTX”)

HTML	R脚本	RgnTX
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,MethylSeq,RNASeq,测序,软件,SplicedAlignment,转录
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.16 (r - 4.2)(< 6个月)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.2.0)
进口	GenomeInfoDb,GenomicFeatures,GenomicRangesggplot2图形,IRanges、方法、地区,S4Vectors统计数据,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
链接
建议	BiocStyle,knitr rmarkdown testthat (> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RgnTX_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	RgnTX_1.0.0.zip
macOS二进制(x86_64)	RgnTX_1.0.0.tgz
macOS二进制(arm64)	RgnTX_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RgnTX
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RgnTX
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/RgnTX/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RgnTX/
包下载报告	下载数据