MsFeatures

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsFeatures

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MsFeatures。

质谱特性的功能

Bioconductor版本:3.16

MsFeature包定义了质谱特性的功能。这包括功能组(质)功能基于他们的一些属性,如保留时间(coeluting功能),或者相关的信号样本。这个packge因此允许组织特性,其结果可以作为输入的QFeatures包允许在每组总丰度水平的功能。这个包定义的概念和功能基础和常见的数据类型,实现更为具体的数据类型预计将实现各自的包(如如。“xcms”)。这个包的所有功能实现模块化的方式,允许不同的分组方法的结合,使其重用在其他R包。

作者:约翰Rainer (aut (cre)

维护人员:约翰Rainer <约翰内斯。在eurac.edu Rainer >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MsFeatures”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MsFeatures”)

HTML	R脚本	分组质谱特征
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施,MassSpectrometry,代谢组学,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1)
进口	方法,ProtGenerics(> = 1.23.5),MsCoreUtils,SummarizedExperiment,统计数据
链接
建议	testthat roxygen2,BiocStyle,knitr pheatmap rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsFeatures
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsFeatures/issues
取决于我
进口我	xcms
建议我	qmtools
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MsFeatures_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	MsFeatures_1.6.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MsFeatures_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64)	MsFeatures_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsFeatures
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MsFeatures
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MsFeatures/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MsFeatures/
包下载报告	下载数据