这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅FuseSOM。
Bioconductor版本:3.16
correlation-based多视图自组织映射特性的细胞类型在高度多路复用原位成像血细胞计数化验(“FuseSOM”)是一种无监督聚类的工具。FuseSOM是健壮和实现高精度结合自组织映射的体系结构和基于多视图的集成相关的指标。这允许FuseSOM集群高度多路复用原位成像血细胞计数分析。
作者:以利亚威利(aut (cre)
维护人员:以利亚威利< ewil3501在uni.sydney.edu.au >
从内部引用(R,回车引用(“FuseSOM”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“FuseSOM”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“FuseSOM”)
HTML | R脚本 | FuseSOM包手册 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBasedAssays,聚类,SingleCell,软件,空间 |
版本 | 1.0.1 |
Bioconductor自 | BioC 3.16 (r - 4.2)(< 6个月) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 4.2.0) |
进口 | 心理、铸造模拟,鸡笼,pheatmap ggplotify, fastcluster, fpc, ggplot2, stringr, ggpubr,代理,集群,diptest,方法,SummarizedExperiment统计数据,S4Vectors |
链接 | Rcpp |
建议 | knitr rmarkdown,SingleCellExperiment |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/ecool50/FuseSOM/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | FuseSOM_1.0.1.tar.gz |
Windows二进制 | FuseSOM_1.0.1.zip |
macOS二进制(x86_64) | FuseSOM_1.0.1.tgz |
macOS二进制(arm64) | FuseSOM_1.0.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FuseSOM |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ FuseSOM |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/FuseSOM/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/FuseSOM/ |
包下载报告 | 下载数据 |