ComplexHeatmap

DOI:10.18129 / B9.bioc.ComplexHeatmap

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ComplexHeatmap。

使复杂的热图

Bioconductor版本:3.16

复杂的热图是有效的可视化不同来源的数据集之间的联系,揭示潜在的模式。这里ComplexHeatmap包提供了一个高度灵活的方式安排多个热图和支持各种注释图形。

作者:Zuguang Gu (aut (cre)

维护人员:Zuguang顾< z。顾在dkfz.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ComplexHeatmap”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ComplexHeatmap”)

HTML		complex_heatmap.html
HTML	R脚本	最可能问的问题
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	测序,软件,可视化
版本	2.14.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(8年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R(> = 3.5.0)、方法、网格,图形,统计,grDevices
进口	GetoptLong circlize(> = 0.4.14),色彩,线索,RColorBrewer, GlobalOptions (> = 0.1.0), png,消化,IRanges,foreach matrixStats doParallel codetools
链接
建议	testthat (> = 1.0.0)、knitr减价,dendsort, jpeg, tiff, fastcluster,EnrichedHeatmapdendextend (> = 1.0.1)、grImport grImport2,胶水,GenomicRanges、gridtext pheatmap (> = 1.0.12) gridGraphics gplots rmarkdown,开罗
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/ComplexHeatmaphttps://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/
取决于我	意大利苦杏酒,EnrichedHeatmap,InteractiveComplexHeatmap,收回
进口我	airpart,ASURAT,BiocOncoTK,BioNERO,blacksheepr,BloodGen3Module,催化剂,celda,CeTF,可可,可乐,COTAN,cytoKernel,DEComplexDisease,DEGreport,部,diffcyt,diffUTR,埃尔默,fCCAC,火焰,gCrisprTools,GeneTonic,GenomicSuperSignature,gmoviz,GRaNIE,爱马仕,InterCellar,iSEE,LineagePulse,MatrixQCvis,MesKit,microbiomeMarker,现代艺术博物馆,蒙娜丽莎,马斯喀特,musicatk,MWASTools,PathoStat,PeacoQC,pipeComp,POMA,profileplyr,RLSeq,sechm,裂殖体,signifinder,simplifyEnrichment,singleCellTK,麻雀,SPIAT,海绵,TBSignatureProfiler,TCGAWorkflow,Xeva,YAPSA
建议我	artMS,bambu,BindingSiteFinder,BrainSABER,clustifyr,CNVRanger,dittoSeq,EnrichmentBrowser,gtrellis,HilbertCurve,msImpute,NanoporeRNASeq,pareg,plotgardener,projectR,proteasy,QFeatures,scDblFinder,的,TCGAbiolinks,TCGAutils,TimeSeriesExperiment,weitrix
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ComplexHeatmap_2.14.0.tar.gz
Windows二进制	ComplexHeatmap_2.14.0.zip
macOS二进制(x86_64)	ComplexHeatmap_2.14.0.tgz
macOS二进制(arm64)	ComplexHeatmap_2.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ComplexHeatmap
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ComplexHeatmap
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ComplexHeatmap/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ComplexHeatmap/
包下载报告	下载数据