AffyCompatible

DOI:10.18129 / B9.bioc.AffyCompatible

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.16版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅AffyCompatible

Affymetrix GeneChip软件兼容性

Bioconductor版本:3.16

这个包提供了一个接口Affymetrix芯片注释和示例属性文件。包允许一个简单的方法让用户下载和管理本地数据基地Affynmetrix NetAffx注释文件。包还提供了访问GeneChip操作系统(GCOS)和GeneChip命令控制台(显示)兼容样本注释文件。

作者:罗伯特·马丁•摩根的绅士

维修工:马丁·摩根<马丁。摩根在roswellpark.org >

从内部引用(R,回车引用(“AffyCompatible”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“AffyCompatible”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“AffyCompatible”)

PDF R脚本 注释与NetAffxResource检索
PDF R脚本 检索法师和ARR样本属性
PDF 参考手册

细节

biocViews 基础设施,微阵列,OneChannel,软件
版本 1.58.0
Bioconductor自 BioC 2.2 (r - 2.7)(15年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.7.0), XML (> = 2.8 1), RCurl(> = 0.8 1)方法
进口 Biostrings
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 AffyCompatible_1.58.0.tar.gz
Windows二进制 AffyCompatible_1.58.0.zip
macOS二进制(x86_64) AffyCompatible_1.58.0.tgz
macOS二进制(arm64) AffyCompatible_1.58.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AffyCompatible
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AffyCompatible
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/AffyCompatible/
包下载报告 下载数据

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请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网