bigPint

DOI:10.18129 / B9.bioc.bigPint

交互式绘制大多元数据

Bioconductor版本:发行版(3.16)

使用静态和交互式散点图矩阵、并行坐标图、火山图和升图可视化大型多元数据集的方法。包括可视化rna测序数据集和差异表达基因的示例。

作者:Lindsay Rutter [aut, cre]， Dianne Cook [aut]

维护者:Lindsay Rutter

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("bigPint")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“bigPint”)

超文本标记语言	R脚本	bigPint装饰图案
超文本标记语言	R脚本	数据度量对象
超文本标记语言	R脚本	推荐RNA-seq管道
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类，DataImport，DifferentialExpression，GeneExpression，MultipleComparison，归一化，预处理，质量控制，RNASeq，测序，软件，转录，可视化
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.6.0)
进口	DelayedArray(> = 0.12.2),dplyr(> = 0.7.2),GGally(> = 1.3.2),ggplot2(> = 2.2.1),图形(> = 3.5.0),grDevices(> = 3.5.0),网格(> = 3.5.0),gridExtra(> = 2.3),hexbin(> = 1.27.1),Hmisc(> = 4.0.3),htmlwidgets(>= 0.9)，方法(>= 3.5.2)情节(> = 4.7.1),plyr(> = 1.8.4),RColorBrewer(> = 1.1.2),重塑(> = 0.8.7),闪亮的(> = 1.0.5),shinycssloaders(> = 0.2.0),shinydashboard(>= 0.6.1)，统计(>= 3.5.0)，stringr(> = 1.3.1),SummarizedExperiment(> = 1.16.1),tidyr(>= 0.7.0)， utils (>= 3.5.0)
链接
建议	BiocGenerics(> = 0.29.1),data.table(> = 1.11.8),EDASeq(> = 2.14.0),刨边机(> = 3.22.2),gtools(> = 3.5.0),knitr(> = 1.13),matrixStats(> = 0.53.1),rmarkdown(> = 1.10),roxygen2(> = 3.0.0),RUnit(> = 0.4.32),宠物猫(> = 1.4.2)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lindsayrutter/bigPint
BugReports	https://github.com/lindsayrutter/bigPint/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	bigPint_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	bigPint_1.14.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	bigPint_1.14.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	bigPint_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bigPint
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bigPint
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/bigPint/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bigPint/
软件包下载报告	下载数据