这是发展ArrayQualityMetrics的版本;对于稳定版本,请参阅ArrayQualityMetrics。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包生成微阵列质量指标报告,用于生物导体微阵列数据容器中的数据(Expressionset,Nchannelset,affybatch)。支持一个和两个颜色阵列平台。
作者:奥黛丽·考夫曼(Audrey Kauffmann),沃尔夫冈·胡伯(Wolfgang Huber)
维护者:迈克·史密斯(Mike Smith)
引用(从r内,输入引用(“ arrayqualitymetrics”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = deS ='devel')biocmanager :: install(“ arrayqualitymetrics”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ arrayqualitymetrics”)
R脚本 | 高级主题:自定义ArrayqualityMetrics报告和输出的程序化处理 | |
R脚本 | 简介:带有阵列的微阵列质量评估 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 微阵列,,,,Onechannel,,,,QualityControl,,,,报告写作,,,,软件,,,,两通道 |
版本 | 3.53.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.1(R-2.6)(15年) |
执照 | LGPL(> = 2) |
要看 | |
进口 | 副词,,,,affyplm(> = 1.27.3),Beadarray,,,,生物酶,,,,GeneFilter,图形,grdevices,网格,网格(> = 1.4-3),HMISC,,,,HWRITER,,,,格子,,,,LatticeExtra,,,,林玛, 方法,rcolorbrewer,,,,setrng,统计,utils,VSN(> = 3.23.3),XML,,,,svglite |
链接 | |
建议 | allmll,,,,CCL4,,,,生物使用,,,,尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/grimbough/arrayqualitymetrics/issues |
取决于我 | Maendtoend |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | arrayqualitymetrics_3.53.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | arrayqualitymetrics_3.53.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/arrayqualitymetrics |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/arrayqualitymetrics |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/arrayqualitymetrics/ |
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