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alevinQC
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DOI:10.18129 / B9.bioc.alevinQC
为Alevin输出生成QC报告
Bioconductor版本:发行版(3.16)
生成总结alevin运行输出的QC报告。报表可以以html或pdf文件的形式生成，也可以以闪亮的应用程序的形式生成。
作者:Charlotte Soneson [aut, cre]
，阿维·斯里瓦斯塔瓦[aut]，罗伯·帕特罗[aut]，何东泽[aut]
维护者:Charlotte Soneson
引文(从R内，输入引用(“alevinQC”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“alevinQC”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | alevinQC |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 质量控制，SingleCell，软件 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年) |
| 许可证 | MIT +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 4.0) |
| 进口 | rmarkdown(>= 2.5)，工具，方法，ggplot2，GGally，dplyr，rjson，闪亮的，shinydashboard，DT，统计，utils，tximport(> = 1.17.4),cowplot，rlang，Rcpp |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | knitr，BiocStyle，testthat(> = 3.0.0),BiocManager |
| SystemRequirements | c++ 11 |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/csoneson/alevinQC |
| BugReports | https://github.com/csoneson/alevinQC/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | alevinQC_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | alevinQC_1.14.0.zip(64位) |
| macOS二进制文件(x86_64) | alevinQC_1.14.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | alevinQC_1.14.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alevinQC |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/alevinQC |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/alevinQC/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/alevinQC/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
