- 家
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- affycoretools
affycoretools
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DOI:10.18129 / B9.bioc.affycoretools
函数用于那些做重复性分析与Affymetrix GeneChips
Bioconductor版本:版本(3.16)
各种包装器函数,写精简分析核心生物可能会看到更为普遍。
作者:詹姆斯·w·麦克唐纳
维修工:詹姆斯·w·麦克唐纳在u.washington.edu < jmacdon >
从内部引用(R,回车引用(“affycoretools”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“affycoretools”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“affycoretools”)
| HTML | R脚本 | 创建带注释的输出与\ Biocpkg {affycoretools}和ReportingTools |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneExpression,微阵列,OneChannel,ReportWriting,软件 |
| 版本 | 1.70.0 |
| Bioconductor自 | BioC 1.8 (r - 2.3)(16.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | Biobase、方法 |
| 进口 | affy,limma,GOstats,gcrma样条函数,xtable,AnnotationDbi,ggplot2,gplots,oligoClasses,ReportingTools,hwriter,晶格,S4Vectors,刨边机,RSQLite,BiocGenerics,DBI,Glimma |
| 链接 | |
| 建议 | affydata,hgfocuscdf,BiocStyle,knitr,hgu95av2.db,rgl,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | AgiMicroRna |
| 进口我 | |
| 建议我 | EnMCB |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | affycoretools_1.70.0.tar.gz |
| Windows二进制 | affycoretools_1.70.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | affycoretools_1.70.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | affycoretools_1.70.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affycoretools |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ affycoretools |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/affycoretools/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/affycoretools/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
