这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅一绺头发。
Bioconductor版本:3.16
这个包是致力于分析MeRIP-seq数据。目前的功能包括1。检测转录组宽m6A甲基化区域2。检测转录组宽微分m6A甲基化区域。
作者:振兴郭(aut (cre),吴皓(施)
维护人员:振兴郭<振兴。郭:emory.edu >
从内部引用(R,回车引用(“枝条”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“枝条”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“枝条”)
HTML | R脚本 | 卷发的用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DifferentialMethylation,表观遗传学,PeakDetection,RNASeq,软件 |
版本 | 1.4.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.14 (r - 4.1)(1.5年) |
许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
取决于 | R(> = 4.1.0),并行,S4Vectors |
进口 | 跑龙套,rtracklayer、矩阵、matrixStats、统计数据、方法、图形、GenomicRanges,GenomicFeatures,IRanges,Rsamtools,AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | knitr rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | TRESS_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制(x86_64) | TRESS_1.4.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | TRESS_1.4.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TRESS |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/卷发 |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/TRESS/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TRESS/ |
包下载报告 | 下载数据 |