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SynExtend
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SynExtend
使用Synteny对象的工具
Bioconductor版本:发行版(3.16)
基因组序列之间的共享顺序提供了大量信息。R包DECIPHER生成的Synteny对象提供了关于共享顺序的定量信息。SynExtend提供了从Synteny对象中提取信息的工具。
作者:Nicholas Cooley [aut, cre]
，艾丹·拉克什曼[au, ctb]，阿德尔·费尔南多[ctb]，埃里克·赖特[aut]
维护者:Nicholas Cooley
引文(从R内，输入引用(“SynExtend”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“SynExtend”)
| R脚本 | UsingSynExtend | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 聚类，ComparativeGenomics，DataImport，遗传学，软件 |
| 版本 | 1.10.2 |
| 在Bioconductor | BioC 3.11 (R-4.0)(3年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 4.2.0)，解读(> = 2.24.0) |
| 进口 | 方法,Biostrings，S4Vectors，IRanges， utils，统计，并行，图形，grDevices |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，igraph，减价，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | SynExtend_1.10.2.tar.gz |
| Windows二进制 | SynExtend_1.10.2.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | SynExtend_1.10.2.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | SynExtend_1.10.2.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SynExtend |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SynExtend |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SynExtend/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SynExtend/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
| BioC 3.16的旧源包 | 源存档 |
