SISPA

DOI:10.18129 / B9.bioc.SISPA

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SISPA。

SISPA:方法示例集成组剖面分析

Bioconductor版本:3.16

样本综合设置概要设计分析(SISPA)是一种方法来定义样本组具有相似基因集富集概要。

作者:巴克提已经和珍妮·科瓦尔斯基

维护人员:巴克提已经<巴克提。德维威迪emory.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SISPA”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“SISPA”)

HTML	R脚本	SISPA:方法示例集成组剖面分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneSetEnrichment,GenomeWideAssociation,软件
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(7.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.5),genefilter,GSVA,changepoint
进口	数据。表、plyr ggplot2
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SISPA_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	SISPA_1.28.0.zip
macOS二进制(x86_64)	SISPA_1.28.0.tgz
macOS二进制(arm64)	SISPA_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SISPA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SISPA
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SISPA/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SISPA/
包下载报告	下载数据