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食人魔
DOI:10.18129 / B9.bioc.OGRE
这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅食人魔。
计算、可视化和分析基因重叠区域
Bioconductor版本:3.16
怪物数据集计算重叠用户定义的基因组区域。任何地区都可以提供即基因单核苷酸多态性,或读取从测序实验。关键数据帮助分析重叠的扩展也可以可视化在基因组水平上。
作者:斯文berr (aut (cre), Jorg Gromoll[所有],马吕斯Woste[所有],莎拉Sandmann[所有],桑德拉Laurentino(施)
维护人员:斯文berr < svenbioinf gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“食人魔”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“食人魔”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“食人魔”)
| HTML | R脚本 | 食人魔 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释,BiologicalQuestion,宏基因组,测序,软件,可视化,WorkflowStep |
| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.15 (r - 4.2)(1年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 4.1.0),S4Vectors |
| 进口 | GenomicRanges、方法、数据。表、为了ggplot2,Gviz,IRanges,AnnotationHubgrDevices统计数据,GenomeInfoDb闪亮的shinyFiles, DT,rtracklayer,shinyBS shinydashboard tidyr |
| 链接 | |
| 建议 | testthat (> = 3.0.0), knitr (> = 1.36), rmarkdown (> = 2.11) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/svenbioinf/OGRE/ |
| BugReports | https://github.com/svenbioinf/OGRE/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | OGRE_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | OGRE_1.2.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | OGRE_1.2.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | OGRE_1.2.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OGRE |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/怪物 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/OGRE/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/OGRE/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
