MuData

DOI:10.18129 / B9.bioc.MuData

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MuData。

MultiAssayExperiment对象的序列化

Bioconductor版本:3.16

保存MultiAssayExperiments h5mu文件支持的μ介子和mudata。子是一个Python框架多通道组学数据的分析。它使用一个HDF5-based格式的数据存储。

作者:Danila Bredikhin (aut (cre),髂骨kat (aut)

维护人员:Danila Bredikhin < Danila。在embl.de bredikhin >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MuData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MuData”)

HTML	R脚本	血液与MuData CITE-seq
HTML	R脚本	脐带血CITE-seq MuData
HTML	R脚本	开始使用MuDataMae
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	矩阵,S4Vectors,rhdf5
进口	方法、统计数据MultiAssayExperiment,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,DelayedArray
链接
建议	HDF5Arraytestthat rmarkdown knitr, fs,BiocStylecovr,SingleCellMultiModal,CiteFuse,嘘
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ilia-kats/MuData
BugReports	https://github.com/ilia-kats/MuData/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MuData_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	MuData_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MuData_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)	MuData_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MuData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MuData
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MuData/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MuData/
包下载报告	下载数据