MsFeatures

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsFeatures

这是发展MsFeatures版本;稳定版请参见MsFeatures．

质谱分析功能

Bioconductor版本:开发(3.16)

MsFeature包定义了质谱特性的功能。这包括根据特征的某些属性(如保留时间(溶蚀特征)或样本间信号的相关性)对特征进行分组(LC-MS)的函数。因此，这个包允许对特征进行分组，其结果可以用作“QFeatures”包的输入，该包允许在每个组中聚集丰富程度的特征。这个包定义了基本数据类型和公共数据类型的概念和函数，更具体的数据类型的实现预计将在各自的包中实现(例如:“xcms”)。该包的所有功能都以模块化的方式实现，允许不同分组方法的组合，并允许在其他R包中重用。

作者:Johannes Rainer [aut, cre]

维护者:Johannes Rainer

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("MsFeatures")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MsFeatures”)

超文本标记语言	R脚本	质谱分组特征
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施，MassSpectrometry，代谢组学，软件
版本	1.5.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.1)
进口	方法,ProtGenerics(> = 1.23.5),MsCoreUtils，SummarizedExperiment,统计数据
链接
建议	testthat，roxygen2，BiocStyle，pheatmap，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsFeatures
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsFeatures/issues
全靠我
进口我	xcms
建议我	qmtools
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MsFeatures_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	MsFeatures_1.5.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	MsFeatures_1.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsFeatures
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsFeatures
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MsFeatures/
软件包下载报告	下载数据