MSstatsLiP

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstatsLiP

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MSstatsLiP。

唇意义分析猎枪质量spectrometry-based蛋白质组学实验

Bioconductor版本:3.16

唇肽和蛋白质的意义分析的工具。为总结提供了功能,嘴唇肽丰富,估计和检测条件的变化。利用整个MSstats家庭包的功能。

作者:德文郡科勒(aut (cre) Tsung-Heng蔡(aut) Ting黄(aut) Mateusz Staniak (aut)之一Meena崔(aut),瓦伦蒂娜意大利水饺(aut),莉莉安娜Malinovska (aut),奥尔加Vitek (aut)

维护人员:德文郡科勒<科勒。d: northeastern.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MSstatsLiP”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MSstatsLiP”)

HTML	R脚本	MSstatsLiP蛋白水解工作流
HTML	R脚本	MSstatsLiP工作流:MSstatsLiP包的工作流和分析一个例子
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,ImmunoOncology,MassSpectrometry,归一化,OneChannel,蛋白质组学,质量控制,软件,TwoChannel
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 3.14 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1)
进口	dplyr、gridExtra stringr、ggplot2 grDevices,MSstats,MSstatsConvertdata.table,Biostrings,MSstatsPTM,将军Rcpp factoextra、ggpubr purrr,宠物猫,tidyr tidyverse,尺度,统计
链接	Rcpp
建议	BiocStyle,rmarkdown knitr covr、tinytest gghighlight
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Vitek-Lab/MSstatsLiP/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MSstatsLiP_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	MSstatsLiP_1.4.1.zip
macOS二进制(x86_64)	MSstatsLiP_1.4.1.tgz
macOS二进制(arm64)	MSstatsLiP_1.4.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstatsLiP
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MSstatsLiP
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MSstatsLiP/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MSstatsLiP/
包下载报告	下载数据