MOFA2
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doi：10.18129/b9.bioc.mofa2
这是发展MOFA2的版本;对于稳定版本，请参阅MOFA2。
多词因素分析V2
生物导体版本：开发（3.16）
MOFA2软件包包含用于培训和分析多词因素分析（MOFA）的工具集合。MOFA是一个概率因素模型，旨在从数据集中识别出可以包含多个OMIC层和/或样本组的数据集的主要变异轴。可以使用MOFA2的一部分使用Mefisto Framework合并样品上的其他时间或空间信息。可以使用下游分析功能，以检查每个因素，远程化，插补等的分子特征。
作者：Ricard Argelaguet [aut]
，达米恩·阿诺尔[aut]，Danila Bredikhin [aut]，Britta Velten [AUT，CRE]
维护者：britta velten
引用（从r内，输入引用（“ MOFA2”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ mofa2”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 贝叶斯，，，，维度，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.7.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） +文件许可证 |
| 要看 | R（> = 4.0） |
| 进口 | RHDF5，，，，dplyr，，，，花花公子，，，，RESHAPE2，，，，pheatmap，，，，GGPLOT2， 方法，rcolorbrewer，，，，牛仔图，，，，Ggrepel，，，，网状，，，，HDF5Array，grdevices，统计，马格里特，，，，福卡，utils，Corrplot，，，，延迟，，，，RTSNE，，，，UWOT，，，，蛇怪，，，，Stringi |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，测试，，，，Seurat，，，，ggpubr，，，，foreach，，，，心理，，，，多亚sayExexperiment，，，，总结性特征，，，，Singlecellexperiment，，，，ggrastr，，，，mvtnorm，，，，ggally，，，，rmarkDown，，，，Data.Table，，，，平淡无奇，，，，生物使用，，，，矩阵，，，，降价 |
| 系统要求 | python（> = 3），numpy，pandas，h5py，scipy，argparse，sklearn，mofapy2 |
| 增强 | |
| URL | https://biofam.github.io/mofa2/index.html |
| BugReports | https://github.com/biofam/mofa2 |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | |
| Windows二进制 | MOFA2_1.7.0.ZIP |
| MacOS 10.13（高山脉） | MOFA2_1.7.0.TGZ |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mofa2 |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/mofa2 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/mofa2/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
