LowMACA

DOI:10.18129 / B9.bioc.LowMACA

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅LowMACA。

通过共识对齐LowMACA -低频变异分析

Bioconductor版本:3.16

LowMACA包是一个简单的工具来调查和分析几种蛋白质的突变概要或包含域通过共识对齐。你可以使用我们的包进行假说驱动的探索性分析提供一组基因或域包含了你的兴趣。

作者:乔治•Melloni,斯特凡诺德Pretis

维护人员:乔治•Melloni < Melloni。乔治在gmail.com >,斯特凡诺德Pretis < ste.depo gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“LowMACA”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“LowMACA”)

HTML	R脚本	HTML文档Bioconductor风格
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	对齐,DataImport,MultipleSequenceAlignment,SequenceMatching,测序,软件,SomaticMutation,WholeGenome
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(8年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10)
进口	cBioPortalData、平行、stringr reshape2,数据。表、RColorBrewer方法,LowMACAAnnotation,BiocParallel,motifStack,Biostrings、httr、网格gridBase plyr
链接
建议	BiocStyle、knitr rmarkdown
SystemRequirements	clustalo、gs、perl
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	LowMACA_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	LowMACA_1.28.0.zip
macOS二进制(x86_64)	LowMACA_1.28.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LowMACA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ LowMACA
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/LowMACA/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/LowMACA/
包下载报告	下载数据