ImmuneSpaceR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ImmuneSpaceR

一层包装ImmuneSpace数据和工具的门户

Bioconductor版本:版本(3.16)

提供了一个方便的API,用于访问数据集在ImmuneSpace数据和工具门户网站(datatools.immunespace.org),数据仓库和分析平台的人类免疫学项目财团(债)。

作者:格雷格Finak (aut),升井Sauteraud (aut),迈克江(aut),吉尔Guday (aut),狮子座Dashevskiy (aut),埃文·亨利克先生(aut),居Yeong金(aut),劳伦·沃尔夫(aut),海伦·米勒(aut),拉斐尔Gottardo (aut) ImmuneSpace包维护者(cre (cph)

维修工:ImmuneSpace包维护者< ImmuneSpace gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ImmuneSpaceR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ImmuneSpaceR”)

HTML	R脚本	介绍ImmuneSpaceR包
HTML	R脚本	下载数据集与getDataset
HTML	R脚本	处理与ImmuneSpaceR矩阵表达式
HTML	R脚本	interactive_netrc()函数介绍
HTML	R脚本	Neutralizition SDY144:相关的海/病毒效价和细胞数量
HTML	R脚本	SDY180:丰富的Plasmablasts衡量多参数流式细胞术
HTML	R脚本	SDY269:关联有关酶联免疫斑点的结果。海和流式细胞术
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,DataRepresentation,软件,ThirdPartyClient
版本	1.26.1
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(7年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	跑龙套,R6,data.table,旋度,httr,Rlabkey(> = 2.3.1),Biobase,pheatmap,ggplot2(> = 3.2.0),尺度统计数据,gplots,情节,的热图(> = 0.7.0),jsonlite,rmarkdown,preprocessCore,flowCore,flowWorkspace,消化
链接
建议	knitr,testthat,covr,withr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RGLab/ImmuneSpaceR
BugReports	https://github.com/RGLab/ImmuneSpaceR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ImmuneSpaceR_1.26.1.tar.gz
Windows二进制	ImmuneSpaceR_1.26.1.zip
macOS二进制(x86_64)	ImmuneSpaceR_1.26.1.tgz
macOS二进制(arm64)	ImmuneSpaceR_1.26.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ImmuneSpaceR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ImmuneSpaceR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ImmuneSpaceR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ImmuneSpaceR/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.16源码包	源存档