HubPub

DOI:10.18129 / B9.bioc.HubPub

实用程序创建和使用Bioconductor集线器

Bioconductor版本:发行版(3.16)

HubPub为用户提供功能,以帮助Bioconductor Hub结构。该包提供了创建Hub样式包的框架的能力,然后用户可以用必要的信息填充该框架。还有一些函数可以帮助向Hub包元数据文件添加资源,以及将数据发布到Bioconductor S3 bucket。

作者:Kayla Interdonato [aut, cre], Martin Morgan [aut]

维护者:Kayla Interdonato < Kayla。roswellpark.org>

引文(从R内,输入引用(“HubPub”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“HubPub”)

超文本标记语言 R脚本 创建一个中心包:ExperimentHub或AnnotationHub
超文本标记语言 R脚本 HubPub:帮助发布Hub包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport基础设施软件ThirdPartyClient
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.13 (R-4.1)(2年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 可用usethisbiocthisdplyraws.s3fsBiocManager,跑龙套
链接
建议 AnnotationHubDataExperimentHubDatatestthatknitrrmarkdownBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/Bioconductor/HubPub/issues
全靠我
进口我
建议我 AnnotationHubAnnotationHubDataExperimentHubExperimentHubData
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 HubPub_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 HubPub_1.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) HubPub_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) HubPub_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HubPub
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HubPub
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/HubPub/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/HubPub/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网