GISPA

DOI:10.18129 / B9.bioc.GISPA

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GISPA。

GISPA:基因集成组谱分析方法

Bioconductor版本:3.16

GISPA方法用于研究人员感兴趣的定义与类似的基因集,先天的指定分子概要文件。GISPA方法之前发表在核酸研究(Kowalski et al ., 2016;PMID: 26826710)。

作者:巴克提已经和珍妮·科瓦尔斯基

维护人员:巴克提已经<巴克提。德维威迪emory.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GISPA”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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HTML	R脚本	GISPA:基因集成组谱分析方法
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文本		新闻

细节

biocViews	GeneSetEnrichment,GenomeWideAssociation,软件,StatisticalMethod
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(6年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.5)
进口	Biobasechangepoint data.table,genefilter、图形、GSEABase晶格,HH latticeExtra、plyr scatterplot3d,统计数据
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GISPA_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	GISPA_1.22.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	GISPA_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64)	GISPA_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GISPA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GISPA
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/GISPA/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GISPA/
包下载报告	下载数据