- 家
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- GDSArray
GDSArray
DOI:10.18129 / B9.bioc.GDSArray
这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GDSArray。
代表GDS类数组对象文件
Bioconductor版本:3.16
GDS文件被广泛用于表示的基因或序列数据。GDSArray包实现“GDSArray”类来表示节点在GDS文件在一个矩阵像表示,允许简单的操作(如构造子集,数学变换)_R_。磁盘上的数据保持在需要之前,这样可以处理非常大的文件。
作者:钱氏(aut (cre),马丁•摩根(aut) Herve页面(aut) Xiuwen郑(aut)
维护人员:钱氏< qliu7 buffalo.edu >
从内部引用(R,回车引用(“GDSArray”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GDSArray”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GDSArray”)
| HTML | R脚本 | GDSArray:代表GDS文件数组类对象 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataRepresentation,GenotypingArray,基础设施,测序,软件 |
| 版本 | 1.18.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.5),gdsfmt、方法、BiocGenerics,DelayedArray(> = 0.5.32) |
| 进口 | 工具,S4Vectors(> = 0.17.34),SNPRelate,SeqArray |
| 链接 | |
| 建议 | rmarkdown testthat knitr,减价,BiocStyle,BiocManager |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/Bioconductor/GDSArray |
| BugReports | https://github.com/Bioconductor/GDSArray/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | CNVRanger,VariantExperiment |
| 建议我 | DelayedDataFrame |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | GDSArray_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | GDSArray_1.18.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | GDSArray_1.18.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | GDSArray_1.18.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GDSArray |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GDSArray |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/GDSArray/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GDSArray/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
