EBImage

DOI:10.18129 / B9.bioc.EBImage

图像处理与分析工具箱为R

Bioconductor版本:版本(3.16)

EBImage提供通用功能进行图像处理和分析。(高通量)的上下文中microscopy-based细胞化验,EBImage提供工具来段细胞和提取细胞定量描述符。这允许使用R编程语言的自动化任务和促进其他工具的使用R信号处理、环境统计建模、机器学习和图像数据可视化。

作者:Andrzej Oleś,格雷戈勒保罗,迈克史密斯,奥列格•Sklyar沃尔夫冈•休伯约瑟夫·巴里和菲利普·a·玛莱的贡献

维护人员:Andrzej Oleś< Andrzej。ole gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“EBImage”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“EBImage”)

HTML	R脚本	介绍EBImage
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文本		新闻

细节

biocViews	软件,可视化
版本	4.40.0
Bioconductor自	BioC 1.8 (r - 2.3)(16.5年)
许可证	LGPL
取决于	方法
进口	BiocGenerics(> =是0.7.1)、图形、grDevices统计,abind,tiff,jpeg,png,locfit,fftwtools7(> = 0.9),跑龙套,htmltools,htmlwidgets,RCurl
链接
建议	BiocStyle,消化,knitr,rmarkdown,闪亮的
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/aoles/EBImage
BugReports	https://github.com/aoles/EBImage/issues
取决于我	红衣主教,CRImage,cytomapper,DonaPLLP2013,FISHalyseR,flowcatchR,furrowSeg,HD2013SGI,imageHTS,MerfishData
进口我	BioImageDbs,bnbc,承认,flowCHIC,的热图,imcRtools,simpleSeg,寄居,突触,山药
建议我	DmelSGI,HilbertVis
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	EBImage_4.40.0.tar.gz
Windows二进制	EBImage_4.40.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	EBImage_4.40.0.tgz
macOS二进制(arm64)	EBImage_4.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EBImage
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ EBImage
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/EBImage/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EBImage/
包下载报告	下载数据