DelayedMatrixStats

DOI:10.18129 / B9.bioc.DelayedMatrixStats

这是发展DelayedMatrixStats版本;稳定的发布版本,请参阅DelayedMatrixStats。

功能适用于“DelayedMatrix”对象的行和列

Bioconductor版本:发展(3.16)

端口使用DelayedMatrix matrixStats的API的对象从“DelayedArray”包。高性能的功能操作DelayedMatrix对象的行和列,例如坳/ rowMedians(),坳/ rowRanks(),和坳/ rowSds ()。每个数据类型和函数优化等部分的计算内存使用和处理时间最小化。

作者:彼得·希基(aut (cre), Herve页(施),亚伦Lun(施)

维修工:彼得希<彼得。希在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“DelayedMatrixStats”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“DelayedMatrixStats”)

HTML	R脚本	概述DelayedMatrixStats
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataRepresentation,基础设施,软件
版本	1.19.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(4.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	MatrixGenerics(> = 1.5.3)更正,DelayedArray(> = 0.17.6)
进口	方法,matrixStats(> = 0.60.0),sparseMatrixStats,矩阵,S4Vectors(> = 0.17.5),IRanges(> = 2.25.10)
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,covr,BiocStyle,微基准测试,profmem,HDF5Array
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/PeteHaitch/DelayedMatrixStats
BugReports	https://github.com/PeteHaitch/DelayedMatrixStats/issues
取决于我
进口我	AUCell,后面;,biscuiteer,bsseq,篮球选手,celldex,Cepo,compartmap,dmrseq,DropletUtils,弗雷泽,glmGamPoi,GSVA,methrix,methylSig,米娅,minfi,mumosa,NxtIRFcore,PCAtools,SCArray,嘘,scMerge,食物,天窗,singleCellTK,单,麻雀,SpliceWiz,weitrix
建议我	DelayedArray,EWCE,MatrixGenerics,mbkmeans,scPCA,弹弓,TrajectoryUtils
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DelayedMatrixStats_1.19.0.tar.gz
Windows二进制	DelayedMatrixStats_1.19.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	DelayedMatrixStats_1.19.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DelayedMatrixStats
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DelayedMatrixStats
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DelayedMatrixStats/
包下载报告	下载数据