DelayedArray

DOI:10.18129 / B9.bioc.DelayedArray

用于透明地处理磁盘上和内存中类似阵列的数据集的统一框架

Bioconductor版本:发行版(3.16)

将类似数组的对象(通常是磁盘上的对象)包装在DelayedArray对象中，可以对其执行常见的数组操作，而无需将该对象加载到内存中。为了减少内存使用和优化性能，对对象的操作要么延迟，要么使用块处理机制执行。注意，这也适用于内存中类似数组的对象，如DataFrame对象(通常带有Rle列)、Matrix对象、普通数组和数据帧。

作者:Hervé Pagès ，with contributions from Peter Hickey and Aaron Lun

维护者:Hervé Pagès

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DelayedArray”)

PDF	R脚本	DelayedArray / HDF5Array更新
超文本标记语言		实现DelayedArray后端
PDF	R脚本	在R中处理大型数组
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，DataRepresentation，GenomeAnnotation，基础设施，软件
版本	0.24.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 4.0.0)，方法，stats4，矩阵，BiocGenerics(> = 0.43.4),MatrixGenerics(> = 1.1.3),S4Vectors(> = 0.27.2),IRanges(> = 2.17.3)
进口	统计数据
链接	S4Vectors
建议	BiocParallel，HDF5Array(> = 1.17.12),genefilter，SummarizedExperiment，气道，lobstr，DelayedMatrixStats，knitr，rmarkdown，BiocStyle，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/DelayedArray
BugReports	https://github.com/Bioconductor/DelayedArray/issues
全靠我	DelayedDataFrame，DelayedMatrixStats，DelayedRandomArray，GDSArray，HDF5Array，restfulSE，restfulSEData，rhdf5client，SCArray，singleCellTK，TileDBArray，VCFArray
进口我	AUCell，后面;，beachmat，bigPint，BiocSingular，bsseq，篮球选手，celaref，celda，celldex，Cepo，ChromSCape，clusterExperiment，compartmap，CRISPRseek，cytomapper，DelayedTensor，DEScan2，DropletUtils，埃尔默，EWCE，flowWorkspace，弗雷泽，GenomicScores，glmGamPoi，GSVA，hipathia，imcdatasets，LoomExperiment，Macarron，mbkmeans，MethReg，methrix，methylSig，米娅，miaViz，minfi，MOFA2，MuData，MultiAssayExperiment，mumosa，NetActivity，netSmooth，NewWave，NxtIRFcore，orthogene，PCAtools，ResidualMatrix，RTCGAToolbox，ScaledMatrix，嘘，scDblFinder，scMerge，scmeth，scPCA，食物，用水晶球占卜，天窗，signatureSearch，SingleCellExperiment，单，SpliceWiz，SummarizedExperiment，transformGamPoi，TSCAN，VariantExperiment，伶盗龙，weitrix，xcore，zellkonverter
建议我	BiocGenerics，ChIPpeakAnno，CNVgears，gwascat，爱马仕，iSEE，桅杆，ProteoDisco，S4Vectors，土星，关注的焦点，SQLDataFrame，TrajectoryUtils
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DelayedArray_0.24.0.tar.gz
Windows二进制	DelayedArray_0.23.2.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	DelayedArray_0.24.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	DelayedArray_0.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DelayedArray
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DelayedArray
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/DelayedArray/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DelayedArray/
软件包下载报告	下载数据