Bioconductor版本:版本(3.16)
实现统计和计算工具分析质谱影像数据集,包括有效的预处理方法、空间分割和分类。
作者:凯莉Bemis a < k。比northeastern.edu >
维修工:凯莉Bemis a < k。比northeastern.edu >
从内部引用(R,回车引用(“红衣主教”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“红衣主教”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“红衣主教”)
HTML | R脚本 | 1。红衣主教2:用户指南进行质谱分析成像分析 |
HTML | R脚本 | 2。红衣主教3:质谱分析成像的统计方法 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 分类,聚类,ImagingMassSpectrometry,ImmunoOncology,基础设施,Lipidomics,MassSpectrometry,归一化,蛋白质组学,回归,软件 |
版本 | 3.0.1 |
Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(7.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | ProtGenerics,BiocGenerics,BiocParallel,EBImage、图形的方法,S4Vectors(> = 0.27.3),统计数据 |
进口 | Biobase,irlba,矩阵,事,magrittr,mclust,nlme平行,信号,spstats4跑龙套,viridisLite |
链接 | |
建议 | BiocStyle,testthat,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.cardinalmsi.org |
取决于我 | CardinalWorkflows |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | Cardinal_3.0.1.tar.gz |
Windows二进制 | Cardinal_3.0.1.zip(64位) |
macOS二进制(x86_64) | Cardinal_3.0.1.tgz |
macOS二进制(arm64) | Cardinal_3.0.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Cardinal |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/红衣主教 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Cardinal/ |
包下载报告 | 下载数据 |
老BioC 3.16源码包 | 源存档 |