CNTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.CNTools

这是发展CNTools版本;稳定的发布版本,请参阅CNTools。

段数据转换成一个地区样本矩阵,以便其他高水平的计算分析。

Bioconductor版本:发展(3.16)

这个包提供了工具来使用DNAcopy细分分析的输出转换为一个矩阵结构重叠段作为样本行和列,这样其他计算分析可以应用于分段数据

作者:Jianhua张

维护人员:张j . < jzhang jimmy.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“CNTools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“CNTools”)

PDF	R脚本	NCTools HowTo
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation,微阵列,软件
版本	1.53.0
Bioconductor自	BioC 2.5 (r - 2.10)(12.5年)
许可证	LGPL
取决于	R(> = 2.10),方法,工具,统计数据,genefilter
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	cghMCR
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CNTools_1.53.0.tar.gz
Windows二进制	CNTools_1.53.0.zip(64位)
macOS 10.13(高山脉)	CNTools_1.53.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNTools
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CNTools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CNTools/
包下载报告	下载数据