CGHnormaliter

DOI:10.18129 / B9.bioc.CGHnormaliter

不平衡像差阵列CGH数据的归一化。

Bioconductor版本:发行版(3.16)

阵列比较基因组杂交(aCGH)数据的规范化和集中化。该算法采用迭代过程,有效地消除了拷贝数不平衡的影响。这可以更可靠地评估副本数量变更(cna)。

作者:Bart P.P. van Houte, Thomas W. Binsl, Hannes Hettling

维护者:Bart P.P. van Houte

引文(从R内,输入引用(“CGHnormaliter”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CGHnormaliter")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“CGHnormaliter”)

PDF R脚本 CGHnormaliter
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列预处理软件
版本 1.52.0
在Bioconductor BioC 2.5 (R-2.10)(13年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 CGHcall(> = 2.17.0),CGHbase(> = 1.15.0)
进口 BiobaseCGHbaseCGHcall,方法,统计,utils
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 CGHnormaliter_1.52.0.tar.gz
Windows二进制 CGHnormaliter_1.52.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) CGHnormaliter_1.52.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) CGHnormaliter_1.52.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CGHnormaliter
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CGHnormaliter
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CGHnormaliter/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/CGHnormaliter/
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