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CGHcall
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DOI:10.18129 / B9.bioc.CGHcall
调用阵列CGH肿瘤剖面畸变。
Bioconductor版本:发行版(3.16)
使用六态混合模型和一些被现有算法忽略的生物学概念调用阵列CGH数据的像差。还提供了概要文件的可视化。
作者:Mark van de Wiel, Sjoerd Vosse
维护者:Mark van de Wiel < Mark。Vdwiel at vumc.nl>
引文(从R内，输入引用(“CGHcall”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“CGHcall”)
| R脚本 | CGHcall | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 微阵列，预处理，软件，可视化 |
| 版本 | 2.60.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.1 (R-2.6)(15.5年) |
| 许可证 | GPL (http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html) |
| 取决于 | R (>= 2.0.0)，嫁祸于(> = 1.8.0),DNAcopy(>= 1.6.0)，方法Biobase，CGHbase(> = 1.15.1),降雪 |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | CGHnormaliter，GeneBreak |
| 进口我 | CGHnormaliter，QDNAseq |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | CGHcall_2.60.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CGHcall_2.60.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | CGHcall_2.60.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | CGHcall_2.60.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CGHcall |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CGHcall |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/CGHcall/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CGHcall/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
