Bioconductor版本:发行版(3.16)
根据KEGG和REACTOME或基因集中描述的途径计算功能相似性。这些相似性可以计算路径或基因集、基因或集群,并与其他相似性相结合。它们可以用来改善网络、基因选择、测试关系……
作者:Lluís雷维拉·桑丘[aut, cre], Pau Sancho-Bru [ths],胡安José萨尔瓦泰拉·洛萨诺[ths]
维护者:Lluís Revilla Sancho
引文(从R内,输入引用(“BioCor”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“BioCor”)
超文本标记语言 | R脚本 | 关于BioCor |
超文本标记语言 | R脚本 | 生物ocor的高级用法 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 聚类,GeneExpression,网络,NetworkEnrichment,通路,软件,StatisticalMethod,SystemsBiology |
版本 | 1.22.0 |
在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | R (>= 3.4.0) |
进口 | BiocParallel,GSEABase,矩阵、方法 |
链接 | |
建议 | 气道,BiocStyle,引导,DESeq2,GOSemSim,Hmisc,knitr(> = 1.35),org.Hs.eg.db,reactome.db,rmarkdown,拼写,targetscan.Hs.eg.db,testthat,WGCNA |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/BioCorhttps://llrs.github.io/BioCor/ |
BugReports | https://github.com/llrs/BioCor/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | BioCor_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | BioCor_1.22.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | BioCor_1.22.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | BioCor_1.22.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioCor |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BioCor |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/BioCor/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BioCor/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |