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BBCAnalyzer
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DOI:10.18129 / B9.bioc.BBCAnalyzer
BBCAnalyzer: R / Bioconductor可视化方案的基础
Bioconductor版本:版本(3.16)
BBCAnalyzer是可视化的包数量相对或绝对的基地,删除和插入在职位序列比对数据定义为bam文件相比,参考基地。标记的相对基本频率,平均质量检测基地,已知的突变和多态性变异叫另外的数据可能被包括在情节。
作者:莎拉Sandmann
维修工:莎拉Sandmann <萨拉。在uni-muenster.de sandmann >
从内部引用(R,回车引用(“BBCAnalyzer”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BBCAnalyzer”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“BBCAnalyzer”)
| R脚本 | 使用BBCAnalyzer | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 对齐,报道,GeneticVariability,单核苷酸多态性,测序,软件 |
| 版本 | 1.28.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(7.5年) |
| 许可证 | LGPL-3 |
| 取决于 | |
| 进口 | SummarizedExperiment,VariantAnnotation,RsamtoolsgrDevices,GenomicRanges,IRanges,Biostrings |
| 链接 | |
| 建议 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | BBCAnalyzer_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | BBCAnalyzer_1.28.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | BBCAnalyzer_1.28.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | BBCAnalyzer_1.28.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BBCAnalyzer |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BBCAnalyzer |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/BBCAnalyzer/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BBCAnalyzer/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
