BBCAnalyzer

DOI:10.18129 / B9.bioc.BBCAnalyzer

BBCAnalyzer: R / Bioconductor可视化方案的基础

Bioconductor版本:版本(3.16)

BBCAnalyzer是可视化的包数量相对或绝对的基地,删除和插入在职位序列比对数据定义为bam文件相比,参考基地。标记的相对基本频率,平均质量检测基地,已知的突变和多态性变异叫另外的数据可能被包括在情节。

作者:莎拉Sandmann

维修工:莎拉Sandmann <萨拉。在uni-muenster.de sandmann >

从内部引用(R,回车引用(“BBCAnalyzer”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BBCAnalyzer”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BBCAnalyzer”)

PDF R脚本 使用BBCAnalyzer
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 对齐,报道,GeneticVariability,单核苷酸多态性,测序,软件
版本 1.28.0
Bioconductor自 BioC 3.2 (r - 3.2)(7.5年)
许可证 LGPL-3
取决于
进口 SummarizedExperiment,VariantAnnotation,RsamtoolsgrDevices,GenomicRanges,IRanges,Biostrings
链接
建议 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 BBCAnalyzer_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 BBCAnalyzer_1.28.0.zip
macOS二进制(x86_64) BBCAnalyzer_1.28.0.tgz
macOS二进制(arm64) BBCAnalyzer_1.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BBCAnalyzer
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BBCAnalyzer
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/BBCAnalyzer/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BBCAnalyzer/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网