AlpsNMR

DOI:10.18129 / B9.bioc.AlpsNMR

核磁共振自动光谱处理系统

Bioconductor版本:发行版(3.16)

读取压缩和解压缩的布鲁克核磁共振数据目录。它为非靶向NMR代谢组学提供自动化和高效的信号处理。它能够插值样本，检测异常值，排除区域，归一化，检测峰值，对齐光谱，整合峰值，管理元数据和可视化光谱。经过光谱处理后，可以对提取的数据进行多元分析。还可以使用1-D数据进行高效绘图。也可提供1D ACD/Labs出口JDX样品的基本读数。

作者:Ivan Montoliu Roura [aut]， Sergio Oller Moreno [aut, cre]，弗朗西斯科·马德里·甘宾[au]，路易斯·费尔南德斯[au]，劳拉López Sánchez [ctb]， Héctor格拉西亚·卡布雷拉[aut]，圣地亚哥·马可Colás [aut]， Nestlé卫生科学研究所[cph]，加泰罗尼亚生物工程研究所[cph]

维护者:Sergio Oller Moreno

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("AlpsNMR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“AlpsNMR”)

PDF	R脚本	AlpsNMR简介(软弃用API)
PDF	R脚本	插图01:AlpsNMR介绍(从这里开始)
PDF	R脚本	小插图02:处理元数据和注释
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	Cheminformatics，分类，DataImport，代谢组学，预处理，软件，可视化
版本	4.0.2
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.2)，未来(> = 1.10.0)
进口	跑龙套,泛型，图形，统计，grDevices，magrittr(> = 1.5),dplyr(> = 0.7.5),信号(> = 0.7 6),rlang(> = 0.3.0.1),尺度(> = 1.2.0),stringr(> = 1.3.1),宠物猫(> = 1.3.4),tidyr(> = 1.0.0),tidyselect，readxl(> = 1.1.0版),purrr(> = 0.2.5),胶水(> = 1.2.0),reshape2(> = 3),mixOmics(> =再),matrixStats(> = 0.54.0),fs(> =)相对于1.2.6,rmarkdown(> = 1.10),speaq(> =测试盒框),htmltools(> = 0.3.6),pcaPP-73年(> = 1.9),ggplot2(> = 3.1.0),基线(> = 1.2 1),vctrs(> = 0.3.0),BiocParallel
链接
建议	BiocStyle，ChemoSpec，cowplot，旋度，DT(> = 0.5),GGally(> = 1.4.0),ggrepel(> = 0.8.0),gridExtra，knitr，情节(> = 4.7.1),progressr，SummarizedExperiment，S4Vectors，testthat(> = 2.0.0),writexl(> = 1.0),邮政编码(> = 2.0.4)
SystemRequirements
增强了
URL	https://sipss.github.io/AlpsNMR/https://github.com/sipss/AlpsNMR
BugReports	https://github.com/sipss/AlpsNMR/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	AlpsNMR_4.0.2.tar.gz
Windows二进制	AlpsNMR_4.0.2.zip
macOS二进制文件(x86_64)	AlpsNMR_4.0.2.tgz
macOS二进制文件(arm64)	AlpsNMR_4.0.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AlpsNMR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/AlpsNMR
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/AlpsNMR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AlpsNMR/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.16的旧源包	源存档