ASpli

DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpli

RNA-Seq选择性剪接分析

Bioconductor版本:发行版(3.16)

使用RNAseq分析替代拼接的综合管道。

作者:埃斯特法尼亚·曼奇尼,安德烈斯·拉宾诺维奇,哈维尔·伊塞尔特,马塞洛·亚诺夫斯基和阿里尔·切尔诺莫雷茨

维护:Estefania Mancini

引文(从R内,输入引用(“ASpli”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ASpli”)

PDF R脚本 ASpli
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 对齐,AlternativeSplicing,报道,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,GenomeAnnotation,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,TimeCourse,转录
版本 2.8.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(6.5年)
许可证 GPL
取决于 方法,grDevices, stats, utils, parallel,刨边机,limma,AnnotationDbi
进口 GenomicRanges,GenomicFeatures,BiocGenerics,IRanges,GenomicAlignments,Gviz,S4Vectors,Rsamtools,BiocStyle,igraph,htmltools,data.table,UpSetR,tidyr,DT,质量,网格,图形,pbmcapply
链接
建议
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ASpli_2.8.0.tar.gz
Windows二进制 ASpli_2.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) ASpli_2.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) ASpli_2.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpli
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ASpli
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ASpli/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ASpli/
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