ASpli

DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpli

RNA-Seq选择性剪接分析

Bioconductor版本:发行版(3.16)

使用RNAseq分析替代拼接的综合管道。

作者:埃斯特法尼亚·曼奇尼，安德烈斯·拉宾诺维奇，哈维尔·伊塞尔特，马塞洛·亚诺夫斯基和阿里尔·切尔诺莫雷茨

维护:Estefania Mancini

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ASpli”)

PDF	R脚本	ASpli
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐,AlternativeSplicing,报道,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,GenomeAnnotation,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,TimeCourse,转录
版本	2.8.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(6.5年)
许可证	GPL
取决于	方法，grDevices, stats, utils, parallel，刨边机,limma,AnnotationDbi
进口	GenomicRanges,GenomicFeatures,BiocGenerics,IRanges,GenomicAlignments,Gviz,S4Vectors,Rsamtools,BiocStyle,igraph,htmltools,data.table,UpSetR,tidyr,DT,质量，网格，图形，pbmcapply
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ASpli_2.8.0.tar.gz
Windows二进制	ASpli_2.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	ASpli_2.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	ASpli_2.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpli
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ASpli
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ASpli/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ASpli/
软件包下载报告	下载数据