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ASpediaFI
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DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpediaFI
ASpedia-FI:可选剪接事件的功能交互分析
Bioconductor版本:发行版(3.16)
这个包提供了对可选剪接事件及其功能交互进行系统和综合分析的功能。
作者:Doyeong Yu, Kyubin Lee, Daejin Hyung, Soo Young Cho, Charny Park
维护者:Doyeong Yu
引文(从R内，输入引用(“ASpediaFI”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“ASpediaFI”)
| R脚本 | ASpediaFI.pdf | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | AlternativeSplicing，注释，报道，GeneExpression，GeneSetEnrichment，GraphAndNetwork，KEGG，网络，NetworkInference，通路，Reactome，测序，软件，转录，可视化 |
| 版本 | 1.11.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(3年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 3.6.0)，SummarizedExperiment，ROCR |
| 进口 | BiocParallel，GenomicAlignments，GenomicFeatures，GenomicRanges，IRanges，iva，Rsamtools，biomaRt，limma，S4Vectors统计数据,DRaWR，GenomeInfoDb，Gviz，矩阵，dplyr，fgsea，reshape2，igraph、图形、e1071、方法、rtracklayer，尺度、网格ggplot2， mGSZ, utils |
| 链接 | |
| 建议 | knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/nachoryu/ASpediaFI |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | ASpediaFI_1.11.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ASpediaFI_1.11.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | ASpediaFI_1.11.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpediaFI |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ASpediaFI |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/ASpediaFI/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ASpediaFI/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
