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Bioconductor工作流包
Bioconductor版本:版本(3.15)
| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| 注释 | Bioconductor包维护者 | 基因组注释资源 |
| 数组 | Bioconductor包维护者 | 使用Bioconductor微阵列分析 |
| BiocMetaWorkflow | 迈克•史密斯 | 关于出版BioC工作流BioC工作流 |
| BP4RNAseq | 令太阳 | 保姆的包复制RNA-seq分析 |
| CAGEWorkflow | 马尔特Thodberg | 一个按部就班的指导,分析使用R / Bioconductor笼数据 |
| chipseqDB | 亚伦Lun | Bioconductor工作流来检测微分ChIP-seq数据绑定 |
| csawUsersGuide | 亚伦Lun | csaw用户指南 |
| cytofWorkflow | 马克·d·罗宾逊 | CyTOF工作流:在大规模高维微分发现血细胞计数数据集 |
| EGSEA123 | 马修·里奇 | 简单和高效的合奏与EGSEA组基因测试 |
| ExpHunterSuite | 詹姆斯·珀金斯 | 包的转录组数据的综合分析 |
| ExpressionNormalizationWorkflow | Karthikeyan Murugesan | 基因表达的标准化工作流程 |
| fluentGenomics | 斯图尔特•李 | plyranges tximeta工作流 |
| generegulation | Bioconductor包维护者 | 寻找候选人通过序列匹配为已知的转录因子结合位点 |
| GeoMxWorkflows | 杰森·里夫斯 | GeoMx数字空间剖析器(DSP)数据分析工作流 |
| highthroughputassays | Bioconductor包维护者 | 使用Bioconductor高吞吐量化验 |
| liftOver | Bioconductor包维护者 | 改变基因组与rtracklayer坐标系统::liftOver |
| maEndToEnd | 斯蒂芬妮Reisenauer | 微分的端到端流程使用Affymetrix微阵列基因表达 |
| methylationArrayAnalysis | Jovana Maksimovic | 为分析甲基化数组数据跨包Bioconductor工作流。 |
| 蛋白质组学 | 劳伦特与 | 质谱和蛋白质组学数据分析 |
| recountWorkflow | 莱昂纳多Collado-Torres | 重新计票工作流程:访问超过70000人与Bioconductor RNA-seq样本 |
| RNAseq123 | 马修·里奇 | RNA-seq分析很容易与limma 1-2-3, Glimma和磨边机 |
| rnaseqDTU | 迈克尔的爱 | RNA-seq工作流为微分成绩单鲑鱼量化后使用 |
| rnaseqGene | 迈克尔的爱 | RNA-seq工作流:能够探索性分析和微分表达式 |
| RnaSeqGeneEdgeRQL | Yunshun陈 | 能够使用Rsubread RNA-seq微分表达式和路径分析和磨边机quasi-likelihood管道 |
| 测序 | Bioconductor包维护者 | 介绍Bioconductor序列数据 |
| simpleSingleCell | 亚伦Lun | 低级的循序渐进的工作流分析单细胞与Bioconductor RNA-seq数据 |
| SingscoreAMLMutations | Dharmesh d Bhuva | 利用转录组singscore预测突变AML签名 |
| TCGAWorkflow | 蒂亚戈Chedraoui席尔瓦 | TCGA工作流分析癌症基因组和表观基因组学数据使用Bioconductor包 |
| 变体 | Bioconductor包维护者 | 注释的基因变异 |
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