这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅sesameData。
Bioconductor版本:3.15
为芝麻包提供了支持注释和测试数据。这包括芯片探戈地址映射信息,性能注释,并训练了英飞纳姆数组数据的预测。这个包提供了用户访问基本注释数据处理的许多代英飞纳姆DNA甲基化数组。目前我们支持人类数组(HM27 HM450,史诗),鼠标数组(MM285)和HorvathMethylChip40 (Mammal40)数组。
作者:周扫读(aut (cre),回族沈(aut),盖Triche(施)
维护人员:扫读周< zhouwanding gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“sesameData”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“sesameData”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“sesameData”)
HTML | R脚本 | sesameData用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,基因组,MethylationArrayData,MicroarrayData |
版本 | 1.14.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 4.1),ExperimentHub,AnnotationHub |
进口 | 跑龙套,readr,stringr,GenomicRanges,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,芝麻,testthat,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | 芝麻 |
进口我 | MethReg |
建议我 | 埃尔默 |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | sesameData_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制(x86_64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sesameData |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sesameData |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/sesameData/ |
包下载报告 | 下载数据 |